Aan de Vrije Universiteit is de bijzondere leerstoel ‘Geschiedenis van de Reformatie’ gevestigd. Deze wordt momenteel bekleed door prof. dr. E.A. de Boer. In de stichting die de leerstoel mogelijk maakt, heeft één van de bestuursleden van de vereniging zitting. Het is dankzij een substantiële bijdrage van Protestants Nederland dat de stichting de leerstoel kan bekostigen.